Sonstiges: |
- Nachgewiesen in: MEDLINE
- Sprachen: English
- Publication Type: Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't
- Language: English
- [J Comput Chem] 2022 May 15; Vol. 43 (13), pp. 917-922. <i>Date of Electronic Publication: </i>2022 Mar 22.
- MeSH Terms: Quantitative Structure-Activity Relationship* ; Molecular Conformation
- References: T. Fujita, D. A. Winkler, J. Chem. Inf. Model. 2016, 56, 269. ; R. Todeschini, V. Consonni, D. Ballabio, F. Grisoni, in Comprehensive Chemometrics, Vol. 2 (Eds: S. D. Brown, R. Tauler, B. Walczak), Elsevier, Amsterdam 2020, p. 599. ; R. D. Cramer, D. E. Patterson, J. D. Bunce, J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 5959. ; G. Klebe, U. Abraham, T. Mietzner, J. Med. Chem. 1994, 37, 4130. ; O. Gürsoy, M. J. Smiesko, ChemInform 2017, 9, 1. ; D.V. Zankov, M. Matveieva, A. Nikonenko, R. Nugmanov, A. Varnek, P. Polishchuk, T. J. Madzhidov, J. Chem. Inf. Model. 2021, 61, 4913. ; A. Nikonenko, D. Zankov, I. Baskin, T. Madzhidov, P. Polishchuk, Mol. Inf. 2021, 40, e2060030. ; S. J. Barigye, M. P. Freitas, Int. J. Quant. Struct.-Prop. Relat. 2016, 1, 64. ; M. R. Freitas, S. J. Barigye, M. P. Freitas, RSC Adv. 2015, 5, 7547. ; J. K. Daré, M. P. Freitas, Chemom. Intell. Lab. Sys. 2021, 2021(212), 104286. ; L. Wang, B.-B. Bao, G.-Q. Song, C. Chen, X.-M. Zhang, W. Lu, Z. Wang, Y. Cai, S. Li, S. Fu, F.-H. Song, H. Yang, J.-G. Wang, Eur. J. Med. Chem. 2017, 137, 450. ; Dennington, R. D., Keith, T. A. and Millam, J. M. GaussView 5.0, Gaussian, Inc., Wallingford, CT, USA, 2008. ; M. J. S. Dewar, E. G. Zoebisch, E. F. Healy, J. J. P. Stewart, J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 3902. ; Spartan'16 Wavefunction, Inc.: Irvine, CA, USA, 2017. ; J. D. Chai, M. Head-Gordon, J. Chem. Phys. 2008, 128, 084106. ; R. Krishnan, J. S. Binkley, R. P. Seeger, J. Chem. Phys. 1980, 72, 650. ; Frisch, M. J., Trucks, G. W., Schlegel, H. B., Scuseria, G. E., Robb, M. A., Cheeseman, J. R., Scalmani, G., Barone, V., Mennucci, B., Petersson, G. A., Nakatsuji, H., Caricato, M., Li, X., Hratchian, H. P., Izmaylov, A. F., Bloino, J., Zheng, G., Sonnenberg, J. L., Hada, M., Ehara, M., Toyota, K., Fukuda, R., Hasegawa, J., Ishida, M., Nakajima, T., Honda, Y., Kitao, O., Nakai, H., Vreven, T., Montgomery, J. A., Peralta, J. E., Ogliaro, F., Bearpark, M., Heyd, J. J., Brothers, E., Kudin, K. N., Staroverov, V. N., Keith, T., Kobayashi, R., Normand, J., Raghavachari, K., Rendell, A., Burant, J. C., Iyengar, S. S., Tomasi, J., Cossi, M., Rega, N., Millam, J. M., Klene, M., Knox, J. E., Cross, J. B., Bakken, V., Adamo, C., Jaramillo, J., Gomperts, R., Stratmann, R. E., Yazyev, O., Austin, A. J., Cammi, R., Pomelli, C., Ochterski, J. W., Martin, R. L., Morokuma, K., Zakrzewski, V. G., Voth, G. A., Salvador, P., Dannenberg, J. J., Dapprich, S., Daniels, A. D., Farkas, O., Foresman, J. B., Ortiz, J. V., Cioslowski, J. and Fox, D.J. Gaussian 09, Revision D.01, Gaussian, Inc., Wallingford CT, USA, 2013. ; C. M. Breneman, K. B. Wiberg, J. Comput. Chem. 1990, 11, 361. ; R. A. Friesner, J. L. Banks, R. B. Murphy, T. A. Halgren, J. J. Klicic, D. T. Mainz, M. P. Repasky, E. H. Knoll, M. Shelley, J. K. Perry, D. E. Shaw, P. Francis, P. Shenkin, J. Med. Chem. 2004, 47, 1739. ; T. A. Halgren, R. B. Murphy, R. A. Friesner, H. S. Beard, L. L. Frye, W. T. Pollard, J. Banks, J. Med. Chem. 2004, 47, 1750. ; J. K. Daré, T. C. Ramalho, M. P. Freitas, Mol. Simul. 2020, 46, 1055. ; Discovery Studio Visualizer 2017R2, Dassault Systèmes, BIOVIA: San Diego, CA, USA, 2017. ; P. Tosco, T. Balle, J. Mol. Model. 2011, 17, 201. ; J. M. Wang, P. Cieplak, P. A. Kollman, J. Comput. Chem. 2000, 21, 1049. ; A. Politi, S. Durdagi, P. Moutevelis-Minakakis, G. Kokotos, M. G. Papadopoulos, T. Mavromoustakos, Eur. J. Med. Chem. 2009, 44, 3703. ; M. Pastor, G. Cruciani, S. Clementi, J. Med. Chem. 1997, 40, 1455. ; M. Baroni, S. Clementi, G. Cruciani, G. Costantino, D. Riganelli, J. Chemom. 1992, 6, 347. ; M. Baroni, G. Costantino, G. Cruciani, D. Riganelli, R. Valigi, S. Clementi, Quant. Struct.-Act. Relat. 1993, 12, 9. ; L. Pohjala, S. Alakurtti, T. Ahola, J. Yli-Kauhaluoma, P. Tammela, J. Nat. Prod. 2009, 72, 1917. ; J. B. Ghasemi, F. Shiri, Med. Chem. Res. 2012, 21, 2788.
- Grant Information: (FAPEMIG); Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; 301371/2017-2 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; 001 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
- Contributed Indexing: Keywords: 2D representation; 3D-QSAR; bioactive conformation; conformational information; optimized structures
- Entry Date(s): Date Created: 20220322 Date Completed: 20220427 Latest Revision: 20220513
- Update Code: 20231215
|