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47 Treffer

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    gMCSpy: efficient and accurate computation of genetic minimal cut sets in Python.
    Rodriguez-Flores, CJ ; Barrena, N ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 40 (2024-06-03), Heft 6
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    SBOannotator: a Python tool for the automated assignment of systems biology ontology terms.
    Leonidou, N ; Fritze, E ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-07-01), Heft 7
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    SBMLDiagrams: a python package to process and visualize SBML layout and render.
    Xu, J ; Jiang, J ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023), Heft 1
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    SBML2HYB: a Python interface for SBML compatible hybrid modeling.
    Pinto, J ; Costa, RS ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023), Heft 1
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    NLoed: A Python Package for Nonlinear Optimal Experimental Design in Systems Biology.
    Braniff, N ; Pearce, T ; et al.
    In: ACS synthetic biology, Jg. 11 (2022-12-16), Heft 12, S. 3921-3928
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    Python interfaces for the Smoldyn simulator.
    Singh, D ; Andrews, SS
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 38 (2021-12-22), Heft 1, S. 291-293
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    MASSpy: Building, simulating, and visualizing dynamic biological models in Python using mass action kinetics.
    Haiman, ZB ; Zielinski, DC ; et al.
    In: PLoS computational biology, Jg. 17 (2021-01-28), Heft 1, S. e1008208
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    CRNT4SBML: a Python package for the detection of bistability in biochemical reaction networks.
    Reyes, BC ; Otero-Muras, I ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 36 (2020-06-01), Heft 12, S. 3922-3924
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    Tellurium: An extensible python-based modeling environment for systems and synthetic biology.
    Choi, K ; Medley, JK ; et al.
    In: Bio Systems, Jg. 171 (2018-09-01), S. 74-79
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
  10. Detailansicht für Treffer 10 öffnen
    PEITH(Θ): perfecting experiments with information theory in Python with GPU support.
    Dony, L ; Mackerodt, J ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 34 (2018-04-01), Heft 7, S. 1249-1250
    academicJournal
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  11. Detailansicht für Treffer 11 öffnen
    ABC-SysBio--approximate Bayesian computation in Python with GPU support.
    Liepe, J ; Barnes, C ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 26 (2010-07-15), Heft 14, S. 1797-9
    academicJournal
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    A Pycellerator Tutorial.
    Shapiro, BE ; Mjolsness, E
    In: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), Jg. 1945 (2019), S. 1-32
    academicJournal
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  13. Detailansicht für Treffer 13 öffnen
    PyRates-A code-generation tool for modeling dynamical systems in biology and beyond.
    Gast, R ; Knösche, TR ; et al.
    In: PLoS computational biology, Jg. 19 (2023-12-27), Heft 12, S. e1011761
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
  14. Detailansicht für Treffer 14 öffnen
    An automated model annotation system (AMAS) for SBML models.
    Shin, W ; Gennari, JH ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-11-01), Heft 11
    academicJournal
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  15. Detailansicht für Treffer 15 öffnen
    Trap spaces of multi-valued networks: definition, computation, and applications.
    Trinh, VG ; Benhamou, B ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-06-30), Heft 39 Suppl 1, S. i513-i522
    academicJournal
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  16. Detailansicht für Treffer 16 öffnen
    StonPy: a tool to parse and query collections of SBGN maps in a graph database.
    Rougny, A ; Balaur, I ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-03-01), Heft 3
    academicJournal
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  17. Detailansicht für Treffer 17 öffnen
    libRoadRunner 2.0: a high performance SBML simulation and analysis library.
    Welsh, C ; Xu, J ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023), Heft 1
    academicJournal
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  18. Detailansicht für Treffer 18 öffnen
    BioSANS: A software package for symbolic and numeric biological simulation.
    Fajiculay, E ; Hsu, CP
    In: PloS one, Jg. 17 (2022-04-18), Heft 4, S. e0256409
    academicJournal
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  19. Detailansicht für Treffer 19 öffnen
    eQuilibrator 3.0: a database solution for thermodynamic constant estimation.
    Beber, ME ; Gollub, MG ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 50 (2022-01-07), Heft D1, S. D603-D609
    academicJournal
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  20. Detailansicht für Treffer 20 öffnen
    Complex Network Analysis in Microbial Systems: Theory and Examples.
    Voigt, A ; Almaas, E
    In: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), Jg. 2349 (2022), S. 167-191
    academicJournal
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