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    Information and Statistical Analysis Pipeline for High-Throughput RNA Sequencing Data.
    Nakaoka, S ; Matsuyama, K
    In: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), Jg. 2109 (2020), S. 199-208
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    Integrated analysis of single-cell RNA sequencing and bulk RNA data reveals gene regulatory networks and targets in dilated cardiomyopathy.
    Zhang, M ; Zhang, X ; et al.
    In: Scientific reports, Jg. 14 (2024-06-17), Heft 1, S. 13942
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    High-Resolution Profiling of Human Vocal Fold Cellular Landscapes With Single-Nuclei RNA Sequencing.
    Laitman, BM ; Charytonowicz, D ; et al.
    In: The Laryngoscope, Jg. 134 (2024-07-01), Heft 7, S. 3193-3200
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    RNA-Seq Data Analysis Pipeline for Plants: Transcriptome Assembly, Alignment, and Differential Expression Analysis.
    Burks, DJ ; Azad, RK
    In: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), Jg. 2396 (2022), S. 47-60
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    FRMC: a fast and robust method for the imputation of scRNA-seq data.
    Wu, H ; Wang, X ; et al.
    In: RNA biology, Jg. 18 (2021-10-15), Heft sup1, S. 172-181
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    NovoSpaRc: flexible spatial reconstruction of single-cell gene expression with optimal transport.
    Moriel, N ; Senel, E ; et al.
    In: Nature protocols, Jg. 16 (2021-09-01), Heft 9, S. 4177-4200
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    Spreading of a new SARS-CoV-2 N501Y spike variant in a new lineage.
    Colson, P ; Levasseur, A ; et al.
    In: Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Jg. 27 (2021-09-01), Heft 9, S. 1352.e1-1352.e5
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    Annotating cell types in human single-cell RNA-seq data with CellO.
    Bernstein, MN ; Dewey, CN
    In: STAR protocols, Jg. 2 (2021-08-17), Heft 3, S. 100705
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    Inferring transcriptomic cell states and transitions only from time series transcriptome data.
    Jo, K ; Sung, I ; et al.
    In: Scientific reports, Jg. 11 (2021-06-15), Heft 1, S. 12566
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    AS-Quant: Detection and Visualization of Alternative Splicing Events with RNA-seq Data.
    Fahmi, NA ; Nassereddeen, H ; et al.
    In: International journal of molecular sciences, Jg. 22 (2021-04-25), Heft 9
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    miRDetect: A combinatorial approach for automated detection of novel miRNA precursors from plant EST data using homology and Random Forest classification.
    Ayachit, G ; Pandya, H ; et al.
    In: Genomics, Jg. 112 (2020-09-01), Heft 5, S. 3201-3206
    academicJournal
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    A novel riboswitch classification based on imbalanced sequences achieved by machine learning.
    Beyene, SS ; Ling, T ; et al.
    In: PLoS computational biology, Jg. 16 (2020-07-20), Heft 7, S. e1007760
    academicJournal
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  13. Detailansicht für Treffer 13 öffnen
    cellHarmony: cell-level matching and holistic comparison of single-cell transcriptomes.
    DePasquale, EAK ; Schnell, D ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 47 (2019-12-02), Heft 21, S. e138
    academicJournal
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  14. Detailansicht für Treffer 14 öffnen
    CAARS: comparative assembly and annotation of RNA-Seq data.
    Rey, C ; Veber, P ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 35 (2019-07-01), Heft 13, S. 2199-2207
    academicJournal
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  15. Detailansicht für Treffer 15 öffnen
    Polled Digital Cell Sorter (p-DCS): Automatic identification of hematological cell types from single cell RNA-sequencing clusters.
    Domanskyi, S ; Szedlak, A ; et al.
    In: BMC bioinformatics, Jg. 20 (2019-07-01), Heft 1, S. 369
    academicJournal
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  16. Detailansicht für Treffer 16 öffnen
    A fast and efficient count-based matrix factorization method for detecting cell types from single-cell RNAseq data.
    Sun, S ; Chen, Y ; et al.
    In: BMC systems biology, Jg. 13 (2019-04-05), Heft Suppl 2, S. 28
    academicJournal
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  17. Detailansicht für Treffer 17 öffnen
    CLIPick: a sensitive peak caller for expression-based deconvolution of HITS-CLIP signals.
    Park, S ; Ahn, SH ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 46 (2018-11-30), Heft 21, S. 11153-11168
    academicJournal
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  18. Detailansicht für Treffer 18 öffnen
    Mixed-species RNA-seq for elucidation of non-cell-autonomous control of gene transcription.
    Qiu, J ; Dando, O ; et al.
    In: Nature protocols, Jg. 13 (2018-10-01), Heft 10, S. 2176-2199
    academicJournal
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  19. Detailansicht für Treffer 19 öffnen
    visnormsc: A Graphical User Interface to Normalize Single-cell RNA Sequencing Data.
    Tang, L ; Zhou, N
    In: Interdisciplinary sciences, computational life sciences, Jg. 10 (2018-09-01), Heft 3, S. 636-640
    academicJournal
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  20. Detailansicht für Treffer 20 öffnen
    ggsashimi: Sashimi plot revised for browser- and annotation-independent splicing visualization.
    Garrido-Martín, D ; Palumbo, E ; et al.
    In: PLoS computational biology, Jg. 14 (2018-08-17), Heft 8, S. e1006360
    academicJournal
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