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    PyWGCNA: a Python package for weighted gene co-expression network analysis.
    Rezaie, N ; Reese, F ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-07-01), Heft 7
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    GReNaDIne: A Data-Driven Python Library to Infer Gene Regulatory Networks from Gene Expression Data.
    Schmitt, P ; Sorin, B ; et al.
    In: Genes, Jg. 14 (2023-01-20), Heft 2
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    R/PY-SUMMA: An R/Python Package for Unsupervised Ensemble Learning for Binary Classification Problems in Bioinformatics.
    Ahsen, ME ; Vogel, R ; et al.
    In: Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology, Jg. 27 (2020-09-01), Heft 9, S. 1337-1340
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    PyPathway: Python Package for Biological Network Analysis and Visualization.
    Xu, Y ; Luo, XC
    In: Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology, Jg. 25 (2018-05-01), Heft 5, S. 499-504
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    PyBoolNet: a python package for the generation, analysis and visualization of boolean networks.
    Klarner, H ; Streck, A ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 33 (2017-03-01), Heft 5, S. 770-772
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    PyPanda: a Python package for gene regulatory network reconstruction.
    van IJzendoorn DG ; Glass, K ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 32 (2016-11-01), Heft 21, S. 3363-3365
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    Modelling Time-Dependent Acquisition of Positional Information.
    Jutras-Dubé, L ; Henry, A ; et al.
    In: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), Jg. 1863 (2018), S. 281-301
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    Integrated analysis of single-cell RNA sequencing and bulk RNA data reveals gene regulatory networks and targets in dilated cardiomyopathy.
    Zhang, M ; Zhang, X ; et al.
    In: Scientific reports, Jg. 14 (2024-06-17), Heft 1, S. 13942
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    Inferring gene regulatory networks from single-cell transcriptomics based on graph embedding.
    Gan, Y ; Yu, J ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 40 (2024-05-02), Heft 5
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    MuDCoD: multi-subject community detection in personalized dynamic gene networks from single-cell RNA sequencing.
    Şapcı, AOB ; Lu, S ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-10-03), Heft 10
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    iLSGRN: inference of large-scale gene regulatory networks based on multi-model fusion.
    Wu, Y ; Qian, B ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-10-03), Heft 10
    academicJournal
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    Demographic confounders distort inference of gene regulatory and gene co-expression networks in cancer.
    Ketteler, A ; Blumenthal, DB
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 24 (2023-09-22), Heft 6
    academicJournal
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  13. Detailansicht für Treffer 13 öffnen
    Dictys: dynamic gene regulatory network dissects developmental continuum with single-cell multiomics.
    Wang, L ; Trasanidis, N ; et al.
    In: Nature methods, Jg. 20 (2023-09-01), Heft 9, S. 1368-1378
    academicJournal
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  14. Detailansicht für Treffer 14 öffnen
    scANANSE gene regulatory network and motif analysis of single-cell clusters.
    Smits, JGA ; Arts, JA ; et al.
    In: F1000Research, Jg. 12 (2023-03-06), S. 243
    academicJournal
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  15. Detailansicht für Treffer 15 öffnen
    GENECI: A novel evolutionary machine learning consensus-based approach for the inference of gene regulatory networks.
    Segura-Ortiz, A ; García-Nieto, J ; et al.
    In: Computers in biology and medicine, Jg. 155 (2023-03-01), S. 106653
    academicJournal
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  16. Detailansicht für Treffer 16 öffnen
    MAGNET: A web-based application for gene set enrichment analysis using macrophage data sets.
    Chen, SY ; Gadhvi, G ; et al.
    In: PloS one, Jg. 18 (2023-01-11), Heft 1, S. e0272166
    academicJournal
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  17. Detailansicht für Treffer 17 öffnen
    Global stabilizing control of large-scale biomolecular regulatory networks.
    An, S ; Jang, SY ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023), Heft 1
    academicJournal
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  18. Detailansicht für Treffer 18 öffnen
    LOICA: Integrating Models with Data for Genetic Network Design Automation.
    Vidal, G ; Vitalis, C ; et al.
    In: ACS synthetic biology, Jg. 11 (2022-05-20), Heft 5, S. 1984-1990
    academicJournal
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  19. Detailansicht für Treffer 19 öffnen
    Fast and accurate inference of gene regulatory networks through robust precision matrix estimation.
    Passemiers, A ; Moreau, Y ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 38 (2022-05-13), Heft 10, S. 2802-2809
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  20. Detailansicht für Treffer 20 öffnen
    PALLAS: Penalized mAximum LikeLihood and pArticle Swarms for Inference of Gene Regulatory Networks From Time Series Data.
    Tan, Y ; Neto, FBL ; et al.
    In: IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics, Jg. 19 (2022-05-01), Heft 3, S. 1807-1816
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